MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas albilineans GPE PC73 plasmid plasmII

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017556	GC	3	6	1673	1678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017556	GC	3	6	1767	1772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017556	TGGCT	2	10	1828	1837	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017556	C	6	6	1868	1873	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_017556	ACCC	2	8	1888	1895	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_017556	A	6	6	2317	2322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017556	CCA	2	6	2365	2370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017556	GTA	2	6	2447	2452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017556	TGT	2	6	2453	2458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017556	TGT	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017556	CT	3	6	2475	2480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017556	ACA	2	6	2484	2489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017556	GCC	3	9	3151	3159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017556	TTC	2	6	3755	3760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017556	GC	3	6	3928	3933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017556	AGCTGG	2	12	3959	3970	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017556	ACGCCG	2	12	3991	4002	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017556	GCG	2	6	4003	4008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017556	CGA	2	6	4010	4015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017556	C	6	6	4033	4038	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_017556	CGGA	2	8	4067	4074	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017556	GCCC	2	8	4143	4150	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_017556	GATG	2	8	4183	4190	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017556	GCG	2	6	4222	4227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017556	TGG	2	6	4267	4272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017556	TGG	2	6	4278	4283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017556	ACC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_017556	GC	3	6	4317	4322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017556	CG	3	6	4347	4352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017556	TCG	2	6	4354	4359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017556	CGG	2	6	4365	4370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017556	CAC	2	6	4403	4408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017556	C	6	6	4454	4459	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_017556	C	6	6	4471	4476	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_017556	CGC	2	6	4508	4513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017556	CCG	2	6	4562	4567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017556	CTC	2	6	4666	4671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017556	ACC	2	6	4672	4677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017556	GC	3	6	4711	4716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017556	TGGG	2	8	4731	4738	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017556	A	7	7	4750	4756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017556	CTA	2	6	4794	4799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017556	TAG	2	6	4819	4824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017556	ACA	2	6	4829	4834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017556	GGC	2	6	4857	4862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017556	CCCG	2	8	5759	5766	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_017556	GCG	2	6	5775	5780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017556	CTT	2	6	5790	5795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017556	GGC	2	6	6116	6121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017556	AC	3	6	6132	6137	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017556	CCA	2	6	6138	6143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017556	CAG	2	6	6144	6149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017556	AAC	2	6	6153	6158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017556	CGC	2	6	6575	6580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017556	AGC	2	6	7122	7127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017556	GA	3	6	7138	7143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017556	GCT	2	6	7191	7196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017556	GGC	2	6	7198	7203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017556	GCA	2	6	7338	7343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017556	CGGT	2	8	7358	7365	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017556	ACC	2	6	7370	7375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017556	TCG	2	6	7389	7394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017556	G	6	6	7400	7405	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017556	GCT	2	6	8456	8461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017556	C	7	7	8469	8475	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
66	NC_017556	TCG	2	6	8488	8493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017556	GCCA	2	8	8497	8504	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017556	CGA	2	6	8551	8556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017556	C	6	6	8573	8578	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
70	NC_017556	GCCC	2	8	8635	8642	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_017556	GATG	2	8	8675	8682	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017556	GCG	2	6	8714	8719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017556	TGG	2	6	8759	8764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017556	ACC	2	6	8778	8783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017556	GC	3	6	8809	8814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017556	ATC	2	6	8845	8850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017556	CGG	2	6	8857	8862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017556	CAC	2	6	8895	8900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017556	C	6	6	8942	8947	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
80	NC_017556	C	6	6	8959	8964	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
81	NC_017556	CGC	2	6	8995	9000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017556	AGA	2	6	9078	9083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017556	CTC	2	6	9152	9157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_017556	ACC	2	6	9158	9163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017556	GC	3	6	9197	9202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017556	CTA	2	6	9278	9283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017556	TAG	2	6	9303	9308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017556	GGC	2	6	9341	9346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017556	ACC	2	6	9348	9353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017556	C	6	6	9352	9357	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
91	NC_017556	AAC	2	6	9367	9372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017556	AAC	2	6	9383	9388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017556	GGC	2	6	10032	10037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017556	GCC	2	6	10041	10046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017556	GC	3	6	11706	11711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017556	T	6	6	11739	11744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017556	CGC	2	6	11836	11841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017556	AT	6	12	11854	11865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017556	TTC	2	6	21916	21921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017556	GAA	2	6	21928	21933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017556	TTG	2	6	21967	21972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017556	CGG	2	6	22002	22007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017556	AT	3	6	22117	22122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017556	AT	3	6	22145	22150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017556	GGT	2	6	23267	23272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017556	GCG	2	6	24300	24305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017556	GCC	2	6	24312	24317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_017556	GTC	2	6	28745	28750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017556	TGA	2	6	28764	28769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017556	CGT	2	6	29063	29068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017556	CCG	2	6	29081	29086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017556	GTT	2	6	29097	29102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017556	CGG	2	6	29119	29124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017556	AGCC	2	8	29130	29137	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017556	ATC	2	6	29268	29273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017556	GTCGCG	2	12	29289	29300	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017556	ATC	2	6	29328	29333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017556	TCA	3	9	29414	29422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017556	ATGG	2	8	29452	29459	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017556	ATT	2	6	29480	29485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017556	CAT	2	6	30264	30269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017556	AAT	2	6	31120	31125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017556	TCG	2	6	31136	31141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.